آنالیز چند شکلی های ژنتیکی در چهار جایگاه نشانگری ژن PEPCK-C در سویه های مختلف مرغ
Authors
Abstract:
This research was carried out in order to detect the polymorphisms in four sites of PEPCK-C gene by PCR-RFLP method in a commercial layer and broiler strains and breeder hens of Mazandaran native fowls breeding station. Blood samples were collected randomly from 150 birds from a three populations and DNA was extracted using modified salting out method. Using polymerase chain reaction (PCR) and specific primers pairs a region with the length of 3792 bp from position -1723 to exon 4 from PEPCK-C gene was amplified. In RsaI marker site two alleles of A (33%) and B (67%) were detected in Mazandaran native fowls, A (34%), B (66%) in commercial broiler and A (24%) and B (76%) in commercial layer population. Two genotypes of AB and BB were detected with the frequency of 66 and 34% in Mazandaran native fowls 68 and 32% in commercial broiler and 48 and 52% in commercial layer hens. In BstEII marker site two alleles of A (28%) and B (72%) were detected in Mazandaran native fowls population, A (19%), B (81%) in commercial broiler and A (59%) and B (41%) in commercial layer lines. Three genotypes of AA, AB and BB were detected with the frequency of 2, 52 and 46 in Mazandaran native fowls, 2, 34 and 64% in commercial broiler and 42, 34 and 24% commercial layer. In PstI marker site two alleles of A (43%) and B (57%) were detected in Mazandaran native fowls population, A (52%), B (48%) in commercial broiler and A and B (50%) in commercial layer samples. Three genotypes of AA, AB and BB were detected with the frequency of 16, 54 and 30% in Mazandaran native fowls, 18, 68 and 14% in commercial broiler and 6, 88 and 6% in commercial layer population. In BstEII marker site (position +26 to +1035) the results showed that all samples from different strains had the same banding pattern with monomorphic BB genotype. Among 3 observed SNPs 2 were in the promoter site and 1 in intron 2 region. As a result of finding polymorphism in this marker site and also its major effect on production traits such as egg for production, feed conversion ratio and growth rate it can be considered as a candidate gene in detection of QTL related to these traits in poultry industry.
similar resources
چند شکلی در ژن pepck-c مرغان بومی سیستان
چکیده ژن فسفوانول پیروات کربوکسی کیناز سیتوزولی (pepck-c) یکی از ژنهای کاندیدای مهم می باشد که آنزیم فسفوانول پیروات کربوکسی کیناز را رمزگذاری می کند که آنزیمی مهم در چرخه گلیکونئوژنسیز می باشد. در ژنوم موجودات زنده دو شکل متفاوت از این ژن وجود دارد: ژن فسفوانول پیروات کربوکسی کیناز سیتوزولی (pepck-c ) و ژن نوع میتوکندریایی (pepck-m ). در این تحقیق به طور تصادفی 100 نمونه از دو جمعیت بومی منطق...
15 صفحه اولمقایسه چند شکلی های تک نوکلئوتیدی جایگاه ژنی mx در سویه های مختلف مرغ
بیماری آنفلوانزای طیور یکی از بیماری های واگیر دار ویروسی موثر بر دستگاه تنفسی، گوارشی و عصبی گونه های متعدد پرندگان می باشدکه دارای قدرت انتشار سریع و از خانواده اورتومیکسوویروس ها می باشد. اینترفرون نوع 1 اولین خط دفاعی قوی و تحریک کننده قوی برای بیان پروتئین های آنتی ویروسی می باشد که اثرات حفاظتی خود را با بیان ژن mx نشان می دهند. یک جابجایی نوکلئوتیدی در جایگاه 2032، موجب تنوع پروتئین در ج...
15 صفحه اولمقایسه چند شکلی های آللی در ژن های فسفوانول پیروات کربوکسی کیناز سیتوپلاسمی و میتوکندریایی در سویه های مختلف مرغ
آنزیم فسفو انول پیروات کربوکسی کیناز (pepck) که به دو فرم سیتوزولی (pepck-c) و میتوکندریایی (pepck-m) شناخته شده است آنزیم کلیدی در چرخه متابولیک گلوکونئوژنز می باشد که اگزالواستات را به فسفو انول پیروات و دی اکسید کربن تبدیل می کند. در حالی که در بیشتر واکنش های گلوکونئوژنز آنزیم های گلیکولیز می توانند در مسیر مخالف استفاده شوند، آنزیم پیروات کیناز یک طرفه می باشد. آنزیم های پیروات کربوکسیلاز ...
15 صفحه اولدسته بندی و آنالیز رخساره های لرزه ای به روش های نظارتی و غیر نظارتی بر اساس آنالیز چند نشانگری
full text
بررسی چند شکلی جایگاه C>A 938 – پروموتر 2P ژن bcl2 در افراد مبتلا به سرطان معده
Background and purpose: Gastric cancer is the fourth most common cancer and the second leading cause of cancer death worldwide. North of Iran is a high risk area for gastric cancer. Bcl2 family is the most important regulator of apoptosis and -938C>A single nucleotide polymorphism of bcl2 gene promoter has been demonstrated to influence gastric cancer susceptibility. In this research we studied...
full textبررسی ارتباط چند شکلی ژنتیکی Val109Asp ژن امنتین با چاقی در زنان ایرانی
Background: obesity is the major health problems affecting communities worldwide and the prevalence is rapidly rising. Obesity as a lifestyle-related factor increases the risk of many diseases. Omentin is a new adipocytokine that is abundantly expressed in visceral fat tissue and its expression levels reversely correlated with obesity. The purpose of this study was to investigate the associatio...
full textMy Resources
Journal title
volume 8 issue 17
pages 115- 121
publication date 2018-01
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
No Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023